Действия игры The Saboteur протекают в период Второй мировой войны на территории оккупированной Франции. Когда войска Третьего рейха начали силой навязывать всем свои правила, нашлись и те, кто не сломился под гнетом, а начал даже активное сопротивление. В их число входит и Шон - главный герой игры. Его задача - внести свой вклад в движение сопротивления и показать нацистам, что волю сильного духом не сломить. В арсенале у игрока имеется все необходимое для выполнения различного рода диверсий, вплоть до внедрения под прикрытием в ряды врага. Одной из особенностей игры The Saboteur является открытость мира, игрок сам волен выбирать время и порядок выполнения заданий.